Le manoir se trouve dans le village de Čiobiškis, district de Širvintos. Il a été construit au XVIe siècle. Le manoir est situé dans une vallée au confluent des rivières Neris et Musė.
Au cours de son histoire ultérieure, ce bâtiment appartenait à la famille Švikovski, puis à la famille Pilsudski. Sous le règne de cette dernière, au XIXe siècle, la construction de bâtiments de manoir en briques a commencé.
Le manoir de Čiobiškis est l'un des manoirs de style classique les plus exclusifs de Lituanie.
Dans l'entre-deux-guerres, le manoir de Čiobiškis est passé à l'État de Lituanie, qui avait restauré son indépendance, et un abri pour enfants y a été créé, puis après la Seconde Guerre mondiale, un internat. De 1965 à 2011, le manoir de Čiobiškis abritait un foyer spécial pour l'éducation et la garde des enfants.
Actuellement, diverses manifestations culturelles et festives, des conférences et des rencontres sont organisées dans le manoir.